公司要扣除我休的年假工资，这合法吗？

不合法，公司不应扣除。依据《劳动法》，劳动者享有带薪年休假权利，单位无权因离职扣除。若被扣，可能面临劳动纠纷及赔偿。
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可协商要求更正，或向劳动局举报，也可申请调解、仲裁。选择方式需根据具体情况，如协商无果则考虑法律途径。
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不合法。操作如下：1.首先与公司协商，明确指出扣除年假工资违法；2.若协商无果，向当地劳动局举报，并提供相关证据；3.亦可考虑申请劳动仲裁，通过法律手段维权，确保合法权益不受侵害。